Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF3P61204 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms