Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms