Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFX3P48380 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFX3P48380 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFX3P48380 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms