Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms