Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms