Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMPOP42166 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMPOP42166 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMPOP42166 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMPOP42166 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMPOP42166 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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