Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPS1P31327 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPS1P31327 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPS1P31327 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPS1P31327 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms