Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT1P26358 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms