Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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