Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT1P21579 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT1P21579 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT1P21579 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT1P21579 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT1P21579 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT1P21579 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT1P21579 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT1P21579 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT1P21579 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT1P21579 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT1P21579 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms