Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK11BP21127 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms