Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP4AP20648 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms