Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms