Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPB42P16452 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPB42P16452 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPB42P16452 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPB42P16452 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPB42P16452 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPB42P16452 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPB42P16452 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPB42P16452 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPB42P16452 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPB42P16452 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPB42P16452 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms