Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLIT2O94813 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms