Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPFIA4O75335 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPFIA4O75335 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms