Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QRK9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QRK9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QRK9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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