Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIPSLA2A3N6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms