Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX4Q9Y2E6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms