Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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