Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms