Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA4BQ9NPR2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms