Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00597Q9H2U6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms