Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms