Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TINF2Q9BSI4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms