Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AKAP9Q99996 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms