Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms