Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP47Q96K76 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms