Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG3Q96JB2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG3Q96JB2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms