Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGGTAQ92696 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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RABGGTAQ92696 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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