Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms