Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms