Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms