Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GEN1Q17RS7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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