Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK4Q16099 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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