Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF4Q15306 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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