Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCF4Q15080 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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