Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUNX3Q13761 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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