Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FHL3Q13643 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms