Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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