Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXF2Q12947 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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