Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NUP160Q12769 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP160Q12769 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms