Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC8Q09428 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC8Q09428 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms