Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms