Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPN11Q06124 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms