Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN12Q05209 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms