Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDR2Q01850 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms