Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKP1P63208 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKP1P63208 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms