Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP25P60880 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP25P60880 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP25P60880 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP25P60880 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP25P60880 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP25P60880 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNAP25P60880 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNAP25P60880 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms