Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN15P56746 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms